湖州师范学院办学历史可追溯至1916年的钱塘道第三联合县立师范讲习所，1958年开始高等教育，1994年开始招收本科生，1999年原湖州师范专科学校、湖州师范学校和湖州教师进修学院合并成立湖州师范学院，2000年原湖州卫生学校并入湖州师范学院。2006年2月6日，习近平同志主政浙江期间莅临湖州师范学院视察，希望学校“因地制宜、体现特色、服务地方”，早日建成“在国内有一定影响、一定水平、一定地位的湖州师范大学”。2012年开始独立招收硕士研究生，2018年获批硕士学位授予单位，2021年独立学院求真学院转设为公办普通本科高校——湖州学院。2022年12月，成为博士学位授予立项建设单位。

学校是“全国文明单位”“全国学雷锋活动示范点”“全国助残先进集体”“全国暑期三下乡社会实践活动优秀单位”“国家第一批卓越医生和卓越农林人才教育培养计划项目试点高校”“全国节约型公共机构示范单位”，是“浙江省应用型建设试点示范学校”“浙江省首批省级涉外法治人才协同培养创新基地建设试点高校”“浙江省课程思政示范校”“浙江省征兵工作成绩突出高校”“浙江省高等学校4A级平安校园”“浙江省绿色学校（三星等级）”等。